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B 轨 · 基因集提名(提交基因列表)

Senescence-associated secretory phenotype (SASP)

https://doi.org/10.1146/annurev-pathol-121808-102144

功能 Preview 版本 — 数据与界面正在快速迭代中,结果口径以发布快照为准。

主判定

单模块名义增益,不显著

不显著不等于该研究没有价值——仅表示在本基准的该决策任务上未检出可测的独立增量。

关键指标

colSingle0.010
colIncr+0.010
colP0.2935
colQ0.4402
nullMean0.0070

分疾病明细

疾病单模块 Recall@20图谱增量
Athero0.0000.000
Dep0.0000.000
Hyper0.0500.000
Osteo0.000+0.050
T2D0.0000.000

家族内评测

归入家族 Hallmarks72 modules 个模块)家族内无增益

家族增量0.000
替代测试0.000
最相似模块(可替代对象)Hallmarks:A1_extracellular_matrix

分疾病家族增量

Athero: 0.00Dep: 0.00Hyper: 0.00Osteo: 0.00T2D: 0.00

与 332 全图谱口径互补:提名作为其最贴近家族(如 Hallmarks)的新成员评测。替代测试回答——若用它换掉同家族最相似的现有模块,家族表现是否不受损。

图谱邻域定位

该基因集在图谱中与 YFY:乌梢蛇食疗本草模块, r = 0.736)最为接近

  • YFY:乌梢蛇食疗本草模块 · r = 0.736
  • YFY:阿胶食疗本草模块 · r = 0.714
  • YFY:蝮蛇食疗本草模块 · r = 0.594
  • YFY:薏苡仁食疗本草模块 · r = 0.594
  • YFY:灵芝食疗本草模块 · r = 0.548

家族贴近度(与各模块家族的平均相关)

衰老标志(Hallmarks)0.18食疗本草模块0.07扩展营养模块(NUTX)0.05营养素模块(NUT)0.03中医模块(TCM)-0.03

基于 z-score 列 Pearson 相关:你的基因集在 332 模块图谱中离哪些经典模块最近——高贴近说明概念与图谱已知区域重叠,低贴近则可能开辟新区域。

最相似模块(冗余度)

  • TCM:乌梢蛇r = 0.736
  • TCM:阿胶r = 0.714
  • TCM:蝮蛇r = 0.594

基于 z-score 列 Pearson 相关的冗余度代理;高相关说明该概念已被现有图谱模块覆盖。

steeramed_bench Table 1 (cv_logistic C=0.1, seeds 42/123/456, capped Recall@20)