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A 轨 · 概念提名(LLM 扩展)

Ferroptosis defense mechanisms

https://www.preprints.org/manuscript/202608.0998/v1

功能 Preview 版本 — 数据与界面正在快速迭代中,结果口径以发布快照为准。

主判定

单模块名义增益,不显著

不显著不等于该研究没有价值——仅表示在本基准的该决策任务上未检出可测的独立增量。

关键指标

colSingle0.000
colIncr+0.011
colP1.0000
colQ1.0000
nullMean0.0070

分疾病明细

疾病单模块 Recall@20图谱增量
Athero0.000+0.053
Dep0.000-0.050
Hyper0.0000.000
Osteo0.0000.000
T2D0.000+0.050

家族内评测

归入家族 NUTX37 modules 个模块)可替代同系列模块

家族增量-0.010
替代测试+0.030
最相似模块(可替代对象)NUTX:Glutathione

分疾病家族增量

Athero: 0.00Dep: -0.10Hyper: 0.00Osteo: 0.00T2D: +0.05

与 332 全图谱口径互补:提名作为其最贴近家族(如 Hallmarks)的新成员评测。替代测试回答——若用它换掉同家族最相似的现有模块,家族表现是否不受损。

图谱邻域定位

该基因集在图谱中与 NUT:NADH营养素模块(NUT), r = 0.507)最为接近

  • NUT:NADH营养素模块(NUT) · r = 0.507
  • NUT:Biotin营养素模块(NUT) · r = 0.499
  • NUTX:Biotin_B7扩展营养模块(NUTX) · r = 0.499
  • NUT:Lipoic acid营养素模块(NUT) · r = 0.474
  • NUTX:Vitamin_B1扩展营养模块(NUTX) · r = 0.465

家族贴近度(与各模块家族的平均相关)

扩展营养模块(NUTX)0.25营养素模块(NUT)0.24食疗本草模块0.21衰老标志(Hallmarks)0.02中医模块(TCM)-0.30

基于 z-score 列 Pearson 相关:你的基因集在 332 模块图谱中离哪些经典模块最近——高贴近说明概念与图谱已知区域重叠,低贴近则可能开辟新区域。

最相似模块(冗余度)

  • NUT:NADHr = 0.507
  • NUT:Biotinr = 0.499
  • NUTX:Biotin_B7r = 0.499

基于 z-score 列 Pearson 相关的冗余度代理;高相关说明该概念已被现有图谱模块覆盖。

AI 提议基因集 (47)

SLC38A1ACO1FTMTSAT2HMOX2PTGS2SLC25A28KEAP1SLC1A5LPCAT3SLC25A37NFE2L1FTH1GOT1ALOXE3PHKG2PCBP1SLC11A2GPX4ALOX5PCBP2NCOA4ALOX12CYB5ASLC39A8GCLCGCH1SLC7A5SLC7A11FECHAIFM2NFE2L2STEAP2BACH1PSAT1ACSL4GCLMPORBLVRBALOX15HMOX1GSSCYB5R1GOT2FTLLPCAT4CYB5R2

概念提名(A 轨)的基因集由 LLM 管道扩展生成并全部公开,供审计与复现。

steeramed_bench Table 1 (cv_logistic C=0.1, seeds 42/123/456, capped Recall@20)