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A 轨 · 概念提名(LLM 扩展)

Clonal hematopoiesis of indeterminate potential

https://www.preprints.org/manuscript/202608.0998/v1

功能 Preview 版本 — 数据与界面正在快速迭代中,结果口径以发布快照为准。

主判定

相对全图谱无独立增量

不显著不等于该研究没有价值——仅表示在本基准的该决策任务上未检出可测的独立增量。

关键指标

colSingle0.000
colIncr0.000
colP1.0000
colQ1.0000
nullMean0.0070

分疾病明细

疾病单模块 Recall@20图谱增量
Athero0.0000.000
Dep0.0000.000
Hyper0.0000.000
Osteo0.0000.000
T2D0.0000.000

家族内评测

归入家族 Hallmarks72 modules 个模块)家族内增强

家族增量+0.010
替代测试0.000
最相似模块(可替代对象)Hallmarks:A4_b_cell_activation

分疾病家族增量

Athero: 0.00Dep: 0.00Hyper: +0.05Osteo: 0.00T2D: 0.00

与 332 全图谱口径互补:提名作为其最贴近家族(如 Hallmarks)的新成员评测。替代测试回答——若用它换掉同家族最相似的现有模块,家族表现是否不受损。

图谱邻域定位

该基因集在图谱中与 YFY:薏苡仁食疗本草模块, r = 0.718)最为接近

  • YFY:薏苡仁食疗本草模块 · r = 0.718
  • YFY:乌梢蛇食疗本草模块 · r = 0.646
  • YFY:灵芝食疗本草模块 · r = 0.614
  • Hallmarks:A4_b_cell_activation衰老标志(Hallmarks) · r = 0.592
  • Hallmarks:A1_senescence衰老标志(Hallmarks) · r = 0.591

家族贴近度(与各模块家族的平均相关)

衰老标志(Hallmarks)0.20食疗本草模块0.09中医模块(TCM)0.03扩展营养模块(NUTX)-0.00营养素模块(NUT)-0.01

基于 z-score 列 Pearson 相关:你的基因集在 332 模块图谱中离哪些经典模块最近——高贴近说明概念与图谱已知区域重叠,低贴近则可能开辟新区域。

最相似模块(冗余度)

  • TCM:薏苡仁r = 0.718
  • TCM:乌梢蛇r = 0.646
  • TCM:灵芝r = 0.614

基于 z-score 列 Pearson 相关的冗余度代理;高相关说明该概念已被现有图谱模块覆盖。

AI 提议基因集 (38)

GSDMDCXCR2STAT3CCR2NLRP3IL6RIKBKBPTPN6BATF2CD38STAT5BSPI1MAPK1CBLBSRSF2DNMT3ANFKBIAPTPN2PYCARDIRF4CXCL8TET2CCR1PTPRCSOCS1IL1BIL6STKITCCR5CEBPASTAT5AIL6ETV6JAK3PPM1DGSDMEPTPN1TP53

概念提名(A 轨)的基因集由 LLM 管道扩展生成并全部公开,供审计与复现。

steeramed_bench Table 1 (cv_logistic C=0.1, seeds 42/123/456, capped Recall@20)